MongoDB — odpowiednik LEFT JOIN, w którym nie istnieje jedna kolekcja

Cóż, twoja edycja w zasadzie ma odpowiedź. Po prostu $match gdzie tablica jest pusta:

db.getCollection('collA').aggregate([
    { "$lookup": {
      "from": "collB",
      "localField": "_id",
      "foreignField": "_id",
      "as": "collB"
    }},
   { "$match": { "collB.0": { "$exists": false } } }
])

$exists test na indeksie tablicy 0 to najskuteczniejszy sposób, aby zapytać w zapytaniu "czy to jest tablica zawierająca elementy?"