Możesz dodać zapytanie do wyciągu aktualizacji:
db.foo.update({'title.de': {$exists : false}}, {$set: {'title.de': ''}})
Aktualizacja
Na twoje zmodyfikowane pytanie moje rozwiązanie wygląda tak - czy to działa dla ciebie? (Jeśli nie, dlaczego?)
db.foo.update({site_id: 'xxx', 'title.de': {$exists : false}}, {$set: {'title.de': ''}, {multi: true})
db.foo.update({site_id: 'xxx', 'content.de': {$exists : false}}, {$set: {'content.de': ''}}, {multi: true})