Drugi parametr populate
jest ciągiem wyboru pola, więc możesz to zrobić w następujący sposób:
Author
.findOne({personcode: code})
.select('-_id -__v')
.populate('bookids', '-_id -__v')
.exec(function (err, data) {
//foo
});
Pamiętaj, że powinieneś połączyć wybrane pola w jeden ciąg.