Pod względem wydajności różnica będzie w najlepszym razie niewielka. Ze względu na to, że Twoje adresy e-mail są unikalne, każdy indeks złożony, który ma pole e-mail, nigdy nie będzie bardziej pomocny niż indeks na samym adresie e-mail. Powodem tego jest to, że pole e-mail ma już maksymalną kardynalność dla Twojej kolekcji, a dalsze pola indeksu nie pomogą bazie danych w szybszym filtrowaniu rekordów, ponieważ zawsze dotrą do właściwych dokumentów z samym polem e-mail.
Pod względem wykorzystania pamięci (co jest bardzo ważne w przypadku baz danych takich jak MongoDB) sam indeks poczty e-mail jest również znacznie mniejszy.
TL; DR:Użyj indeksu tylko na adresie e-mail.
