Najłatwiej jest przekonwertować BSON na JSON i użyć API java.io do zapisania tych danych do plików. Odwrotnością byłoby użycie Reader API (BufferedReader lub FileReader), aby je odczytać i przekonwertować na BSON.
Teraz, aby przekonwertować BSON na JSON, jest wiele sposobów, zależy od używanych narzędzi, a także API na oficjalnym sterowniku Mongo, który możesz wybrać. Odwrotna sytuacja jest również prawdziwa, w tym wątku jest wiele opcji.
(Tworzenie obiektu BSON z ciągu JSON )
Możesz także odwołać się do https://api.mongodb.com/java/3.0/org/bson/BsonDocument.html#toJson-org.bson.json.JsonWriterSettings-
Mam nadzieję, że ci to pomoże :)