Używasz rozszerzonej składni json, która jest nieodpowiednia do konstruowania wykresów obiektów w aplikacji. Zamiast tego powinieneś konstruować obiekty odpowiedniego typu.
Na przykład zobacz tutaj dla długiego przykładu.
const BSON = require('bson');
const Long = BSON.Long;
const doc = { long: Long.fromNumber(100) };