Możesz skonfigurować parametry połączenia przez uri.
spring.data.mongodb.uri=mongodb://localhost:27017/?connectTimeoutMS=300000&minPoolSize=0&maxPoolSize=10&maxIdleTimeMS=900000
Zapoznaj się z poniższą dokumentacją dotyczącą innych parametrów.
https://docs.mongodb.com/manual/ reference/connection-string/#connections-connection-options