Właśnie natknąłem się na ten sam problem. Ernie Hershey z MongoDB pomógł mi rozwiązać ten problem, odpowiadając na mój post w grupie użytkowników MongoDB:
https://groups.google.com/forum/#!topic /mongodb-user/5xRQW7ER4hE
Zasadniczo musisz uruchomić yum makecache
przed uruchomieniem yum install mongodb-org
z powodu błędu w sposobie generowania pakietów MongoDB RC. To rozwiązało problem dla mnie.