Ten sam problem rozwiązałem wczoraj wieczorem w ten sposób:
> db.test.aggregate({$group:{_id:{$gt:["$field", null]}, count:{$sum:1}}})
{ "_id" : true, "count" : 2 }
{ "_id" : false, "count" : 2 }
Zobacz http://docs.mongodb.org /manual/reference/bson-types/#bson-types-comparison-order aby uzyskać pełne wyjaśnienie, jak to działa.