Mongodb:Znajdź wszystkie dokumenty, w których co najmniej jeden element tablicy nie pasuje?

Możesz to zrobić, pakując swój $nin w $elemMatch operatora, tak aby $nin jest stosowany oddzielnie do każdego elementu sections zamiast zestawu elementów jako grupy:

Group.find({ sections: { $elemMatch: { $nin: archived_sections } } })
    .exec(function(err, groups){
        res.send(groups);
    }
);

Jeśli przynajmniej jeden element spełnia $elemMatch zapytanie, dokument pasuje.