To tylko kwestia zainstalowania wersji 3.5.8.2. Zobacz http://docs.phpmyadmin.net/en/latest /setup.html#szybka instalacja .
Jeśli nie zainstalowałeś tabel przechowywania konfiguracji phpMyAdmin, które są specyficzne dla wersji 4, nie masz nic więcej do zrobienia. Oczywiście zależy to od adresu URL, którego używasz do odwiedzenia phpMyAdmin, oraz od tego, czy samodzielnie zainstalowałeś wersję 4.0, czy użyłeś instalacji paczkowanej.
Nie rozumiem, dlaczego w ten sposób stracisz swoje bazy danych.