Kiedy używać MyISAM i InnoDB?

MyISAM:

MyISAM silnik pamięci masowej w MySQL.

Prostsze w projektowaniu i tworzeniu, a więc lepsze dla początkujących. Nie martw się o obce relacje między tabelami.
Szybszy niż InnoDB w całości dzięki prostszej strukturze, a tym samym znacznie niższym kosztom zasobów serwera. -- Przeważnie już nie jest prawdą.
Indeksowanie pełnotekstowe. -- InnoDB już to ma
Szczególnie dobre dla tabel z intensywnym odczytem (wybrane). -- Przeważnie już nie jest prawdą.
Ślad dysku jest 2x-3x mniejszy niż w InnoDB. -- Od wersji 5.7 jest to prawdopodobnie jedyna prawdziwa zaleta MyISAM.

InnoDB:

InnoDB silnik pamięci masowej w MySQL.

Obsługa transakcji (obsługa ACID właściwość).
Blokowanie na poziomie wiersza. Posiadanie bardziej precyzyjnego mechanizmu blokowania zapewnia wyższą współbieżność w porównaniu na przykład z MyISAM .
Ograniczenia dotyczące kluczy obcych. Pozwalając na zapewnienie przez bazę danych integralności stanu bazy danych i relacji między tabelami.
InnoDB jest bardziej odporny na uszkodzenia tabeli niż MyISAM.
Obsługa dużej puli buforów dla danych i indeksów. Bufor klucza MyISAM jest przeznaczony tylko dla indeksów.
MyISAM jest w stagnacji; wszystkie przyszłe ulepszenia będą dostępne w InnoDB. Stało się to bardzo jasne wraz z wprowadzeniem wersji 8.0.

Ograniczenia MyISAM:

Brak kluczy obcych i kaskadowe usuwanie/aktualizacja
Brak integralności transakcyjnej (zgodność z ACID)
Brak możliwości cofania
4 284 867 296 wierszy (2^32) — to stare domyślne . Konfigurowalny limit (dla wielu wersji) to 2**56 bajtów.
Maksymalnie 64 indeksy na tabelę

Ograniczenia InnoDB:

Brak pełnego indeksowania tekstu (wersja mysql poniżej 5.6)
Nie można skompresować do szybkiego, tylko do odczytu (wprowadzono 5.5.14 ROW_FORMAT=COMPRESSED )
Nie można naprawić tabeli InnoDB

W celu uzyskania krótkiego zrozumienia przeczytaj poniższe linki: