Wypróbuj SET GLOBAL slow_query_log = 'ON';
i być może FLUSH LOGS;
Zakładamy, że używasz MySQL 5.1 lub nowszego. Jeśli używasz wcześniejszej wersji, musisz ponownie uruchomić serwer. Jest to udokumentowane w Podręczniku MySQL . Możesz skonfigurować dziennik w pliku konfiguracyjnym lub w wierszu poleceń.