Miałem podobny problem. Odpowiedź, jak wskazał EO2, jest taka, że domyślny zestaw znaków jest przestarzały w wersji 5.5. Powinieneś zamiast tego użyć:
character-set-server = utf8
BTW, lepiej jeśli odpowiedzi są odpowiedziami, a nie komentarzami...;-)