Proponuję spróbować dwóch rzeczy:
1. Sprawdź uprawnienia
Upewnij się, że Twój katalog danych MySQL i wszystkie znajdujące się w nim pliki należą do użytkownika mysql i grupy mysql. Może tak nie być, jeśli skopiowałeś pliki na lokalną maszynę testową jako użytkownik root:
chown -R mysql:mysql your-mysql-data-dir-here
2. Napraw uszkodzone tabele
Użyj mysqlcheck aby sprawdzić uszkodzone tabele i naprawić je, jeśli jakieś znajdzie:
mysqlcheck -u root -p --auto-repair --all-databases
Jeśli po tym nadal nie możesz korzystać z tabel, wypróbuj mysqldump!