Cytując podręcznik referencyjny (Ustawianie silnika pamięci masowej ):
Opcja default-storage-engine musi być częścią sekcji mysqld w my.cnf;
[mysqld]
default-storage-engine = innodb
Możesz także zmienić domyślny silnik przechowywania tylko dla bieżącej sesji. Możesz to zrobić, ustawiając storage_engine
zmienna:
SET storage_engine=INNODB;