Tak, to może mieć wpływ.
Oczywiście te dwa indeksy zajmują dodatkowe miejsce na dysku, a także w pamięci, jeśli są używane.
Ale powodują również, że optymalizator zapytań wykonuje więcej pracy w celu obliczenia korzyści z każdego indeksu podczas każdego SELECT. Im więcej masz indeksów, tym więcej przypadków musi porównać. Dlatego opłaca się wyeliminować naprawdę nadmiarowe indeksy.
Jak zauważyli również inni, indeksy są aktualizowane podczas operacji INSERT/UPDATE/DELETE, więc im więcej masz indeksów, tym większe obciążenie to reprezentuje. Indeksy, które są często używane, uzasadniają własne obciążenie, ale zduplikowane indeksy pochłaniają więcej kosztów bez dodatkowych korzyści do dopasowania.
Jeśli jesteś zainteresowany, Percona Toolkit ma narzędzie pt-duplicate-key-checker który przeszukuje wszystkie Twoje tabele pod kątem takich przypadków.
