Ok. Znalazłem odpowiedź, folder, do którego dodałem bazę danych, był niewłaściwy. Chociaż znalazłem 2 foldery „data”, trzeci był ukryty w C:\ ApplicationData; kiedy dodałem tutaj moje pliki danych i ponownie uruchomiłem usługę MySQL, mogłem zobaczyć dane.