Spróbuj sprawdzić, czy nie ma błędów mysql na komputerze z Linuksem (zwykle znajduje się w /var/log/mysql/error.log ).
Upewnij się, że wersja PHP i MySQL na komputerze z systemem Linux jest taka sama jak na komputerze z systemem Windows na wypadek są na nich błędy w poszczególnych wersjach.
