Użyj PDO zamiast jednego z tych podejść. Pozwoli ci to na użycie parametrów zamiast ciągów.
$sth = $dbh->prepare('SELECT * FROM users WHERE username = :username AND password = :password LIMIT 1');
$sth->bindParam(':username', $username, PDO::PARAM_STR);
$sth->bindParam(':password', $password, PDO::PARAM_STR);
$sth->execute();
Przy okazji, upewnij się, że nie używasz jednocześnie haseł w postaci zwykłego tekstu.