MySQL używa sortowania kolumny dla indeksu. Indeks z niebinarnym sortowaniem nie jest przydatny do wyszukiwania binarnego, ponieważ kolejność może być inna.
Możesz zmienić samą kolumnę na sortowanie binarne:
ALTER TABLE YourTable MODIFY
YourColumn VARCHAR(4)
CHARACTER SET latin1
COLLATE latin1_bin;
Wtedy indeks byłby przydatny do wyszukiwania binarnego.