Niestety w MySQL nie ma zamiany/aktualizacji wyrażeń regularnych. Jeśli to tylko nawiasy, myślniki i spacje, to niektóre zagnieżdżone REPLACE
telefony załatwią sprawę:
UPDATE table_name
SET Phone = REPLACE(REPLACE(REPLACE(REPLACE(Phone, '-', ''), ')', ''), '(', ''), ' ', '')