Zmierzyłem się z tym samym problemem. Oprócz korzystania z tych:
cnxn.setdecoding(pyodbc.SQL_CHAR, encoding='utf-8')
cnxn.setdecoding(pyodbc.SQL_WCHAR, encoding='utf-8')
cnxn.setencoding(encoding='utf-8')
Dodanie tego rozwiązało problem dla mnie:
cnxn.setdecoding(pyodbc.SQL_WMETADATA, encoding='utf-32le')