Musisz usunąć klucz obcy według nazwy ograniczenia, a nie nazwy kolumny, w której jest zdefiniowany.
Nie w porządku:
mysql> ALTER TABLE `articles` DROP FOREIGN KEY `pubsrc_id`;
ERROR 1091 (42000): Can't DROP 'pubsrc_id'; check that column/key exists
Dobrze:
mysql> ALTER TABLE `articles` DROP FOREIGN KEY `pub_articles_ibfk_1`;
Query OK, 0 rows affected (0.03 sec)