Czy występuje problem z właściwościami JPA Entities, Oracle 10g i Calendar Type?

Z tego właśnie powodu nie należy używać Kalendarza do uzyskiwania dostępu do dat z bazy danych. Powinieneś użyć java.util.Date tak:

@Temporal(TemporalType.TIMESTAMP)
@Column(name="activationDate")
public Date getActivationDate() {
    return this.activationDate;
}

java.util.Date wskazuje na moment w czasie, niezależnie od stref czasowych. Kalendarza można używać do formatowania daty dla określonej strefy czasowej lub regionu.