Według dokumentacji możesz wysłać SIGTERM lub SIGQUIT. SIGTERM jest preferowany. Tak czy inaczej, nigdy nie używaj SIGKILL (jak wiesz z własnego doświadczenia).
Edytuj: z drugiej strony to, czego doświadczasz, nie jest normalne i może wskazywać na błędną konfigurację lub błąd. Poproś o pomoc na pgsql-admin lista mailingowa.