Aby wykonać kopię zapasową pojedynczej bazy danych z wiersza poleceń, użyj osql lub sqlcmd.
"C:\Program Files\Microsoft SQL Server\90\Tools\Binn\osql.exe"
-E -Q "BACKUP DATABASE mydatabase TO DISK='C:\tmp\db.bak' WITH FORMAT"
Będziesz także chciał przeczytać dokumentację dotyczącą tworzenia kopii zapasowych i przywracania oraz ogólnych procedur.