Jak niejawna konwersja działa z porównaniami (<>) reprezentacji varchar liczb całkowitych w SQL Server?

Nie możesz. 3 < 200, ale '3' > '200' . Podczas pracy na VARCHAR operatory porównania używają alfanumerycznego porządku sortowania zdefiniowanego przez COLLATION.

Np.:

drop table if exists #t 

create table #t(PayCode varchar(20))
insert into #t(PayCode) values ('3')

select *
from #t
WHERE PayCode > '200'