Możesz użyć $gdzie. Pamiętaj tylko, że będzie to dość powolne (musi wykonać kod JavaScript na każdym rekordzie), więc połącz z indeksowanymi zapytaniami, jeśli możesz.
db.T.find( { $where: function() { return this.Grade1 > this.Grade2 } } );
lub bardziej kompaktowy:
db.T.find( { $where : "this.Grade1 > this.Grade2" } );
UPD dla mongodb v.3.6+
możesz użyć $expr jak opisano w ostatniej odpowiedzi
