Mając listę identyfikatorów, jaki jest najlepszy sposób na sprawdzenie, które identyfikatory nie istnieją w kolekcji?

Przypuszczam, że masz w swojej kolekcji następujące dokumenty:

{ "_id" : ObjectId("55b725fd7279ca22edb618bb"), "id" : 1 }
{ "_id" : ObjectId("55b725fd7279ca22edb618bc"), "id" : 2 }
{ "_id" : ObjectId("55b725fd7279ca22edb618bd"), "id" : 3 }
{ "_id" : ObjectId("55b725fd7279ca22edb618be"), "id" : 4 }
{ "_id" : ObjectId("55b725fd7279ca22edb618bf"), "id" : 5 }
{ "_id" : ObjectId("55b725fd7279ca22edb618c0"), "id" : 6 }

i następującą listę id

var listId = [ 1, 3, 7, 9, 8, 35 ];

Możemy użyć .filter metoda zwracająca tablicę ids którego nie ma w Twojej kolekcji.

var result = listId.filter(function(el){
    return db.collection.distinct('id').indexOf(el) == -1; });

Daje to

[ 7, 9, 8, 35 ] 

Teraz możesz także korzystać z struktur agregacji i $setDifference operatora.

db.collection.aggregate([
   { "$group": { "_id": null, "ids": { "$addToSet": "$id" }}}, 
   { "$project" : { "missingIds": { "$setDifference": [ listId, "$ids" ]}, "_id": 0 }}
])

To daje:

{ "missingIds" : [ 7, 9, 8, 35 ] }