Wypróbuj $unset w wywołaniu update() .
Tak:
db.collection_name.update({ _id: 1234 }, { $unset : { description : 1} })
I, jak skomentował vikneshwar, jeśli chcesz usunąć jedno pole ze wszystkich (lub wielu) dokumentów, możesz użyć updateMany() tak:
db.collection_name.updateMany({}, { $unset : { description : 1} })
