W końcu znalazłem rozwiązanie, zamieniając „mongo-java-driver-2.11.3.jar” na „mongo-java-driver-2.13.2.jar” w moim katalogu z bibliotekami Apache-JMeter. Może ma pewne problemy z uwierzytelnianiem Mongo 3.
Zmodyfikowałem też kod, aby działał:
import com.mongodb.*
import com.mongodb.BasicDBObject
MongoCredential coreCredential = MongoCredential.createCredential("${mongodb_user}", "${mongodb_database}", "${mongodb_password}".toCharArray());
MongoClient coreMongoClient = new MongoClient(new ServerAddress("${mongodb_server}", 27017), Arrays.asList(coreCredential));
DB coreDB = coreMongoClient.getDB("${mongodb_database}");
DBCollection coll = coreDB.getCollection("users");
...
teraz wszystko działa dobrze.