Ja też w to wpadłem. Okazuje się, że może to być spowodowane dwiema rzeczami.
1. If the node you are adding already has its own dbData.
2. If you ran rs.initiate() on both nodes. It is only supposed to be run on the primary.
Aby rozwiązać ten problem, musisz sprawdzić w /etc/mongod.conf atrybut „dbPath” i przenieść lub usunąć wszystkie pliki w tym folderze.