mongodb-java POJO nie zwraca identyfikatora

Nie musisz używać @BsonId , możesz po prostu użyć @Id i data-type pola id powinno być String . W takim przypadku otrzymasz 12bit Identyfikator wygenerowany przez mongo.

public class Person {

    @Id
    private String id;

    @NotNull
    @JsonProperty
    private String name;

}