Nie można używać Mongodb oddzielnie w Nodejs

distinct metoda akceptuje query obiekt jako drugi parametr, spróbuj tego:

mongodb_data.distinct(
   "acc",
   {}, // query object
   (function(err, docs){
        if(err){
            return console.log(err);
        }
        if(docs){  
            console.log(docs);
        }
   })
);