Musisz dodać krok $group do potoku.
_id grupy będzie tym, przez co sumujesz (w tym przypadku stałą, ponieważ chcesz uzyskać sumę końcową). Ponieważ chcesz zachować listę faktur, możesz gromadzić je w polu tablicy za pomocą operatora $push. Sumy dla sumy i ilości będą obsługiwane za pomocą $sum.
{$group : { _id : 1,
Total : { $sum : "$total" },
ItemCount : { $sum : "$qty" },
Invoices : { $push : { id : "$_id", created : "$created" }}
} }