Musisz użyć MongoDate obiekt do zapytania.
Dla bieżącej daty możesz użyć new MongoDate()
które powodują inicjalizację MongoDate z bieżącą datą
Jeśli chcesz przekazać jakąś niestandardową datę, możesz użyć strtotime do konwersji typu String na Date
$stringtime = "2016-04-09 00:00:00"
$inputdate = strtotime($stringtime)
a następnie przekazanie go do konstruktora MongoDate, aby uzyskać odpowiedni obiekt.
new MongoDate($inputdate)
zapoznaj się z Dokumentacją PHP