Sugerowałbym używanie mongostatu podczas przeprowadzania testów. Jest wiele rzeczy, które mogą się mylić, ale mongostat da ci dobrą wskazówkę.
http://docs.mongodb.org/manual/reference/mongostat/
Pierwsze dwie rzeczy, na które chciałbym spojrzeć, to procent blokady i przepustowość danych. Przy rozsądnej przepustowości na dedykowanych maszynach zazwyczaj dostaję się do 1000-2000 aktualizacji/wstawek na sekundę, zanim doznam jakiejkolwiek degradacji. Tak było w przypadku kilku dużych wdrożeń produkcyjnych, z którymi pracowałem.