Jak rekursywnie przeglądać zagnieżdżony dokument w MongoDB?

Najłatwiej to zrobić, używając obietnic bluebird, a konkretnie each , props , reduce i map metody, w zależności od przypadku użycia.

W twoim przypadku proponuję coś w stylu

var bluebird = require('bluebird');
var mongoose = require('mongoose');
var UserModel = mongoose.model('User');

function getUser(userId) {
  return UserModel.findOne({_id: userId}).lean().exec()
    .then(function(user){
      return bluebird.props({
        firstName: user.firstName,
        parents: bluebird.map(user.parents, getUser),
        children: bluebird.map(user.children, getUser),
        partner: bluebird.map(user.partner, getUser),
        sibling: bluebird.map(user.sibling, getUser)
      })
    });
}

// Then call getUser once on the root node, e.g.
getUser(rootUserObjectId)
  .then(function(userTree){
    console.log(userTree)
  })

Daj mi znać, jak to idzie!