Jeśli używasz MongoDB 4.2, możesz użyć operatorów agregacji w instrukcji aktualizacji, takich jak:
.findOneAndUpdate({_id: day.id},[{$set:{present:{$eq:[false,"$present"]}}}]);
To ustawi present
na prawdę, jeśli jest fałszem, i na fałsz, jeśli jest to jakakolwiek inna wartość.