Możesz użyć poniższego potoku agregacji.
Poniższe zapytanie spowoduje $unwind tag_id po którym następuje $group liczyć email i $cond operator do zliczania unread e-mail.
db.collection.aggregate(
{$unwind:{path:"$tag_id", preserveNullAndEmptyArrays:true}},
{$group:{
_id:"$tag_id",
count_email:{$sum:1},
unread:{$sum:{$cond:[{$eq:["$unread", "false"]}, 0, 1]}}
}
}
);