W końcu to znalazłem.
Najwyraźniej po aktualizacji do MySQL 5.6 wystąpiły pewne problemy z kompatybilnością.
Aby sprawdzić takie problemy i je naprawić, musisz wykonać aktualizację MySQL.
Po prostu uruchom następujące polecenie na terminalu:
mysql_upgrade -u root -p
Wprowadź swoje hasło i poczekaj, aż aktualizacja się zakończy.
To rozwiązało problem dla mnie.