Uruchom to zapytanie, a prawdopodobnie otrzymasz to, czego szukasz:
SELECT table_schema "DB Name",
ROUND(SUM(data_length + index_length) / 1024 / 1024, 1) "DB Size in MB"
FROM information_schema.tables
GROUP BY table_schema;
To zapytanie pochodzi z forum mysql , gdzie dostępne są bardziej szczegółowe instrukcje.