Na żądanie, teraz jako odpowiedź...
Podczas korzystania z przeglądarki MySQL Query Browser lub phpMyAdmin wydaje się, że dla każdego zapytania otwierane jest nowe połączenie (bugs.mysql.com/bug.php?id=8280 ), przez co konieczne jest zapisanie wszystkich instrukcji drop w jednym zapytaniu, np.
SET FOREIGN_KEY_CHECKS=0;
DROP TABLE my_first_table_to_drop;
DROP TABLE my_second_table_to_drop;
SET FOREIGN_KEY_CHECKS=1;
Gdzie SET FOREIGN_KEY_CHECKS=1
służy jako dodatkowy środek bezpieczeństwa...