Przede wszystkim powinieneś znormalizować strukturę danych i mieć tabelę połączeń między kluczami 2 a tabelą edukacyjną.
Aby sprzężenie działało z obecną strukturą danych, użyj find_in_set() funkcja:
SELECT *
FROM education AS a
JOIN keys2 AS b on find_in_set(b.`List Idsubjek`,a.`List Idsubjek`)>0
WHERE b.`List Idsubjek` IN (52, 54, 55, 67)
AND `studentid` = '$id'