Wreszcie znalazłem to, czego szukałem...
W my.cnf,
[mysqld_safe]
timezone = UTC
Umieściłem tę opcję w [mysqld] i mysql nie uruchamiał się.
Wywołanie "SET time_zone='+0:00';" przy każdym załadowaniu strony również zadziała, ale nie podoba mi się pomysł wywoływania tego zapytania przy każdym załadowaniu strony.