Właśnie w to wpadłem. Instalacja mysql była trochę dziwna i brakowało /var/run/mysqld/
MySQLd próbował utworzyć gniazdo i plik blokady, ale brakowało katalogu nadrzędnego. Po prostu stworzyłem katalog
sudo mkdir /var/run/mysqld
zmieniłem to na mysql
sudo chown mysql:mysql /var/run/mysqld
Wtedy mogłem normalnie uruchomić mysqld.
