Czy próbowałeś następujących rzeczy?
SET autocommit=0;
SET unique_checks=0;
SET foreign_key_checks=0;
Z referencji MySQL https:// /dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/optimizing-innodb-bulk-data-loading.html
Zobacz sekcję „Wskazówki dotyczące zbiorczego ładowania danych "
