mysql konwertuje wiele wierszy na kolumny w jednym wierszu

MySQL nie ma składni PIVOT/UNPIVOT, co pozwala na użycie kombinacji wyrażeń GROUP BY i CASE:

INSERT INTO SUMMARY
  (user_id,valueA,valueB) 
  SELECT d.user_id,
         MAX(CASE WHEN d.code = 5 THEN d.value ELSE NULL END),
         MAX(CASE WHEN d.code = 6 THEN d.value ELSE NULL END),
    FROM DETAILS d
GROUP BY d.user_id