Jak naprawić ten błąd mysql_fetch_assoc() oczekuje, że parametr 1 będzie zasobem, podanym w wartości logicznej?

$query jest używany przed while i wewnątrz while ... Zmień nazwę zmiennej na $query2 , na przykład:

$hoje = strtotime(date("d-m-Y"));

$db = new DBConfig();
$db -> config();
$db->conn();
$query = mysql_query("SELECT * FROM products WHERE auto_pub = ".$hoje) or die(mysql_error());

while($res = mysql_fetch_assoc($query)) {
    $query2 = mysql_query("UPDATE products SET publicado = '0' WHERE auto_pub = ".$hoje) or die(mysql_error());
}

$db->close();

Mam nadzieję, że to pomoże.